SQL par l'exemple

La bioinformatique est une discipline récente qui propose et développe des modèles, des méthodes et des outils afin d'analyser l'information biologique disponible et produire de nouvelles connaissances. C'est à ce titre une science interdisciplinaire en développement rapide, qui fait appel à des connaissances pointues en mathématique, en informatique et en biologie. Introduction à la bioinformatique est un ouvrage d'initiation. Il offre un panorama des différents outils et techniques actuellement disponibles. Il livre également des conseils pour utiliser au mieux les logiciels existants et les adapter aux besoins spécifiques du chercheur. Les différents thèmes abordés dans ce livre sont : la station de travail bioinformatique, notamment sous Linux ; les techniques de recherche d'informations biologiques sur le Web ; l'analyse et la comparaison de séquences ; les alignements multiples de séquences ; la visualisation de structures protéiques et le calcul de propriétés structurales ; la prédiction de la structure et de la fonction d'une protéine à partir de sa séquence ; les outils pour la génomique et la protéomique ; l'automatisation de l'analyse de données avec Perl ; le développement de bases de données biologiques ; la visualisation et la fouille de données (data mining). Cet ouvrage s'adresse aussi bien aux étudiants en biologie soucieux d'acquérir une approche informatique qu'aux biologistes expérimentés s'initiant à la manipulation de ces données sur ordinateur ou encore aux informaticiens possédant des connaissances de base en biologie qui souhaitent découvrir la bioinformatique.

Apache est l'un des logiciels Open Source les plus populaires. Plus de la moitié des sites Web publics l'utilise aujourd'hui, et il accroît tous les jours sa présence, en Intranet comme sur l'Internet. Gratuit et amélioré sans relâche par une équipe de développeurs de très haut niveau, il fonctionne aussi bien sous MS-Windows que sous Unix. Les administrateurs de serveurs Web trouveront dans ce guide la description des lignes de commandes, des options, des directives de configuration, des modules et des utilitaires d'Apache. La version de référence est la 1.3.12, mais le contenu de cet ouvrage peut s'appliquer à d'autres versions, ainsi qu'à certains serveurs Web dérivés d'Apache. Cet ouvrage est le compagnon de Apache - Installation et mise en ?uvre et de Writing Apache Modules with Perl and C.

Perl/TK est une extension de Perl grâce à laquelle l'interface utilisateur des programmes devient graphique. Avec Tk, les programmes Perl ne sont plus limités au mode texte mais créent fenêtres graphiques, boutons, zones de saisie, boîtes de liste, menus et barres de défilement. Tk libère le développeur du confinement de la ligne de commande et lui permet de construire des applications graphiques répondant à des événements, sous MS-Windows comme sous Unix. Cet ouvrage est destiné aux novices comme aux experts. Il présente les concepts de la programmation événementielle et détaille le meilleur mode de conception d'applications à interfaces graphiques. Il montre, étape par étape, comment implanter et configurer les éléments graphiques de Perl/Tk. Une attention particulière est portée aux gestionnaires d'espace, responsables du placement de chaque bouton, menu, étiquette et boîte de liste dans une fenêtre. Pour chacun des widgets de Perl/Tk couramment utilisés vous trouverez dans ce livre : ? une présentation générale et un exposé des utilisations courantes, avec des exemples, ? les options de configuration, ? les méthodes permettant de le manipuler ou de peaufiner son comportement, ? des exercices vous permettant de vous familiariser avec ses applications. Bien que ce livre n'enseigne pas les bases du langage, toute personne ayant écrit même le plus simple programme Perl devrait pouvoir apprendre Tk grâce à lui. Le style d'écriture, agréable et aéré, va droit au but. Ce livre est riche en illustrations montrant l'aspect de chaque élément et l'effet des options de configuration sur sa présentation. Il a été écrit pour tous les programmeurs Perl souhaitant implanter des interfaces graphiques simples et faciles à utiliser. " Cet excellent ouvrage traite au mieux de Perl/Tk. Le paragraphe de la préface faisant référence aux 'gourous' apprenant eux aussi grâce à lui s'est avéré vrai, même pour moi ". - Nick Ing-Simmons, créateur de Perl/Tk. L'édition française a été réalisée en LaTeX sous le système d'exploitation FreeBSD, à l'aide de XEmacs et d'AucTeX.

Dernier-né de la famille Caml, Objective Caml est l'un des langages fonctionnels les plus intéressants du moment, qui allie programmation fonctionnelle, impérative, et orientée objet. Outre les avantages bien connus des langages fonctionnels, on y trouve tout ce qui fait, l'attrait des langages modernes, notamment son modèle objet original, ses fonctionnalités de multithreading, d'accès réseau, etc. Par ailleurs, le typage statique, l'inférence de type, ou le mécanisme de traitement des exceptions, combinées à une gestion automatique de la mémoire le rangent définitivement dans la catégorie des langages ultra-puissants. Cet ouvrage vous dira tout sur Objective Caml et vous permettra de réaliser des applications étonnamment efficaces : ? La partie I est consacrée au noyau du langage. Les notions étudiées débouchent sur l'écriture d'un interprète BASIC complet ou d'un jeu de " démineur ". ? La partie II aborde les outils de développement. Après avoir passé en revue les bibliothèques, les différents outils d'analyse ou l'interopérabilité avec C, on y apprend notamment à construire une interface graphique complexe. ? La partie III montre comment organiser des applications en Objective Caml. On y parle de modules et d'objets, et les applications étudiées incluent des jeux à deux joueurs comme Puissance 4 ou la programmation de robots. ? La partie IV a pour thème concurrence et répartition. Il y est donc question de threads, de pipes, et autres sockets, qui conduisent naturellement à la programmation de servlets ou au développement de clients et serveurs HTTP. Diffusé librement par ses créateurs de l'INRIA (sous licences LGPL et QPL), la distribution officielle d'Objective Caml s'installe sans difficulté aussi bien sur Unix que sur Windows. Le CD-ROM inclus dans cet ouvrage contient non seulement les toutes dernières versions (sources et binaires) d'Objective Caml, mais aussi les sources complets du livre en HTML, les solutions aux exercices, et de nombreux programmes et outils, parmi lesquels le fameux HEVEA (convertisseur LaTeX --> HTML).